Para emitir una nota de crédito, esto se puede realizar por medio de la opción Facturación -> Emitir nota de crédito:
En esta opción se mostrará una ventana como la siguiente, donde debemos seleccionar el tipo de documento que queremos modificar o anular con la nota de crédito (debe ser un documento ingresado en Facto):
Tras seleccionar el tipo de documento, e ingresar el número de folio, se muestra una ventana donde se llenarán automáticamente la mayoría de los campos requeridos para la nota de crédito, tan solo debe seleccionar el tipo de operación, verificar la fecha y llenar el motivo y datos faltantes:
Una vez listos los datos, se genera la nota de crédito en Facto y se guarda como borrador, para enviarla al S.I.I., es necesario buscar esta nota de crédito en la opción Facturación -> Buscar Documentos Tributarios, abrirla y ahí emitir el documento.
También es posible crear notas de crédito desde la opción Facturación -> Emitir Documento Tributario, pero esto requiere llenar toda la información como si se emitiera una nueva factura, además de incluir manualmente las referencias a los documentos que modifica la nota de crédito, por lo que es preferible utilizar la alternativa explicada anteriormente.